يختص قسم الجراحة بتدريس ثلاثة اجزاء هى الجراحة والتخدير والاشعة للحيوانات الكبيرة والصغيرة

ويتم تدريس المادة على اربعة فصول دراسية على مدار عامين للفرقتين الرابعة والخامسة

ويتم تدريس الجراحة العامة والتخدير للفرقة الرابعة وايضاً الجراحة الخاصة والاشعة للفرقة الخامسة 

ويختص قسم الجراحة ايضاً بتدريس العديد من المقررات المتخصصة والاختيارية فى جميع نواحى مادة

الجراحة وفى مختلف الحيوانات لطلاب الدراسات العليا بمختلف مراحلها وذلك بنظام الساعات المعتمدة