الميكروبيولوجيا و المناعة هي إحدى المواد الأساسية في العلوم الصيدلية و هي تختص بنواحي تحليل العينات الإكلينيكية و الأشكال الصيدلية للدواء من حيث وجود كائنات دقيقة و خلافه و التي لها أهمية حيوية لجودة الدواء و أمانه للمريض
و يهدف القسم إلى التوصل لأحدث أساليب الكشف عن الكائنات الدقيقة في الأدوية و العينات الإكلينيكية و أحدث أساليب الكشف عن الاستجابة المناعية للجسم ضد الميكروبات المختلفة.