تحت رعاية أ.د/ماجد عبد التواب القمري رئيس الجامعة  نظمت الجامعة يوم الأثنين  الموافق29/2/2016م ندوة إسلامية لمواجهة الإلحاد  بكلية العلوم، بحضور عدد من رجال الدين بالأزهر الشريف فى شكل حلقة نقاشية مفتوحة يتصدرها فضيلة الشيخ / عاصم رأفت الكتامي والشيخ/ أسامة عبد الرحمن ،وأ.د/ علي أبو شوشة نائب رئيس الجامعة لشئون البيئة وخدمة المجتمع  وعميد الكلية ،وقد جاءت فكرة الندوة نتيجةإثارة موضوع الإلحاد فى الإعلام الفترة الماضية، وهو الأمر الذى دفع  الجامعة الي تنظيم حلقة نقاشية للرد على الشكوك التى قد تدفع بعض الشباب للاتجاه للإلحاد. وأفاد شيوخ الأزهر الشريف ، أن بعض الشباب قد يشرد ذهنه إلى أسئلة غيبية تحتاج إلى رد منطقى من رجل دين متخصص،  وهو ما توفره  هذةالندوة.

كماأكدوا سيادتهم علي أن الأسباب الرئيسية لأنتشار الألحاد في الفترة الماضية هو عدم الفهم الصحيح للدين والتاريخ الأسلامي الوسطي والجهل بة ومحاكاة ثقافات الدول الأوروبية المخالفة للشرع والدين وظاهرة أختلاف الفتاوي بين العلماء التي تسبب تشتت الفكر  وذلك عن طريق بعض البرامج الأعلامية ومواقع الأنترنت الغير موثوق فيها  والتي يتم بثها لتنفيذ الأجندات الخارجية وبث الأشاعات  الهدامة وهدم القدواة  والتشكيك في الدين الأسلامي و كذلك غياب الخطاب العقلي لمخاطبة الشباب لأنهم هم ثروة  وأمل الأمة الأسلامية كما يجب عليهم أن يتسموا بالفطنة والوطنية وعدم الأنسياق وراء الأشاعات المغرضة والتي تهدم الأوطان .