يهتم القسم بعلوم الكيمياء وكيمياء المبيدات ومكافحة الآفات وحماية البيئة ويتمحور الهيكل العلمى للقسم فى تجهيز المبيدات، التقييم الحيوى، والتقييم الحقلى، تطبيقات المكافحة المتكاملة، تحليل المبيدات ومتبقياتها، الدراسات التكسكولوجية، حماية البيئة من التلوث بالمبيدات